2023.12.16
良くある質問2022年
自分だけの溶剤セットを作るには？
最も簡単な方法は、小さな例題セット（例えば第2章）をロードして、すべての溶媒をハイライトして削除することです。あるいは，File Newを選択すると，次のステップのために自動的にマスターリストが開かれ，空白の表が得られます。マスターリストで順番に溶媒を探し、ダブルクリックすると、その溶媒が自動的に自分の溶媒リストに送られます。このソフトウェアは、同じ溶媒を誤って2回追加することを防ぎます。マスターリストで溶媒を探すには、名前（大文字と小文字は区別されません）、Cas番号、分子式で検索することができます。Getting Startedのビデオでは、これらの方法を紹介しています。もう一つの方法は、Sphere Solvent Dataを開き、含まれる溶媒を検索し、そのスコアを記録することです。未使用の溶媒は、delete unused機能で削除することができます。
Solvent Optimizerのリストに溶媒Xがないのはなぜですか？
おそらく、追加することを思いつかなかったからでしょう。マスターデータベースから右クリックで簡単に溶媒を追加することができます。また、Solvent Optimizerの中で自分で溶媒を追加することもできます。溶媒のAntoine係数を見つけるのに苦労することがあるかもしれません。私達はいくつかの大規模なデータベースにアクセスしましたが、時には目的の分子に関するものが見つからず、合理的な近似値を使用していることがあります。良い近似値は、何も値を入力しないよりも優れています。
Solvent Optimizerのリストに溶媒Xがあるのはなぜですか？
デフォルトのリストでは、すべてのユーザーを満足させることはできません。私たちは意図的に多めに追加しています。行をハイライトして、不要な行を削除するのはとても簡単です。リストを新しい名前で保存することを忘れないでください。ソフトウェアはあなたの選択を記憶しており、次回HSPiPを実行した時にはあなたの新しいリストが不要な溶媒を除いてそこにあるはずです。
なぜ、化学物質XのHSPは、私が他で見つけたもの（あるいはハンセンブック第2版に掲載されているもの）と違うのですか？
HSPの完璧なリストは存在しない。新しい情報があれば，我々はその値を更新しなければならない。例えば、第1版から第5版までの間に、我々は20の値を変更する正当な理由があったし、将来の版のために微調整や改訂を続けることを期待している。幸いなことに、これらの変更の多くは小さなものであり、リスト全体に対する割合もごくわずかです。我々はHSPiPのユーザーの皆さんに、特定のHSPについて我々に挑戦し続けることをお勧めする。そして、変更を裏付ける良いデータを他の情報源から得ることができた時には、我々は変更を継続するつもりだ。
Y-MB、S-P、Hoyなどの予測値が大きく異なる場合があるのはなぜですか？
グループ寄与法は，決して完全なものではない。データの質にも、サブグループとサブグループの相互作用の選択にも依存する。我々は、最終的には、何が特定の分子に対して妥当なHSPセットであるかを判断するのはあなた自身でなければならない、と飽きることなく言い続けている。DIYで全てのツールを使い、何よりも蒸発のエンタルピーからδTotを突き止め、内部バランスに疑問があっても、少なくとも全体のHSP値がフィットしていることを確認できるようにしよう。独立した測定値（例えばIGC）が得られれば，グループ寄与法を見直したり更新したりすることができる。Hoyの値は、企業内部の中で、彼にとっては非常にうまく機能していたようだ。彼の方法論は完全には公開されておらず、パラメータの定義もハンセンとは系統的に異なっていることは明らかである。したがって、Hoyの値とHansenの値を混同してはいけない。また、異なる手法の平均値を取って、どの数値よりも良くなることを期待してはいけない。私たちがY-MBの値を支持するのは、この数年、体系的に改良されてきたからである。
Polymer HSPの予測で時々おかしな結果が出る。なぜか？
ポリマーのビデオにある最後の例を見てほしい。我々が言ったように、この新しい技術はまだ初期段階にある。根源的な問題は、十分に特性化されたポリマーの高品質なHSPの値が十分に公表されていないことだ。実用的な予測式を提供することは困難だ。我々は最善を尽くし続ける。
非常に大きな分子でY-MBを計算できないのはなぜか？。
Y-MBの現在の上限は120個の “重い “原子，つまり，H以外の原子だ。これを増やして，例えば，たくさんの側鎖を持つ大きなポリマーのHSPを膨大なSMILES文字列で計算できるようにしてはどうだろうか？
原子の数が多ければ多いほど、分子中のどのフラグメントが何であるかを調べるのに時間がかかる。しかし、このような大きな分子でY-MBを推定することは、科学的にあまり意味のあることではない。これは一見、衝撃的な言葉だろう。私たちは、大きな分子にはY-MBは使えないと言っているように見える。これにはちゃんとした理由がある。例えば、PE:PEOのような、半分が炭化水素、もう半分が酸素で構成されるジブロック分子を想像してほしい。Y-MBはPEとPEOの値の約半分の値を与える。これは「正しい」が、役に立たない。PE:PEOは平均的な分子として振る舞うのではなく、2つの非常に異なる分子が結合したものとして振る舞うのだ。これは極端な例です。しかし、ステロイドのような複雑な医薬品を想像してみてほしい。大きなステロイドの部分は大部分が疎水性で、親水性の糖がたくさんついた大きな複雑な側鎖があるかもしれない。Y-MBは平均値を出すが、これはその分子の科学的な特徴を捉えたものではない。
では、どのような答えがあるのだろうか。原理的には、Y-MBは分子を自動的に2つの領域に分割し、2つの値を計算し、その平均値を提供することができる。しかし、人間にとって分子を2つの領域に分けることは自明かもしれないが、コンピュータにとっては不可能に近い作業である。つまり、科学者はコンピュータより賢いので、自分で分割するべきだということだ。分子をお気に入りの化学構造ソフトウェアに取り込み、2つに分割し（分割点に適切な官能基をつける）、ソフトウェアにそれぞれの構造のSMILESを生成させ、それぞれの構造のY-MBを計算し、結合した分子で何が起こるかについて自分なりに結論を出す。
問題は、分割点に適切な官能基を見つけることだ。例えば、2つのパーツがエステル結合で結合しているとする。一方が-OHで終わり、もう一方が-CO2Hで終わるように分割することができる。しかし、この場合、2つの-OH官能基が導入され、δHの値が非現実的なほど高くなる。この場合、片方の半分を-OMeで、もう片方を-CO2Meで終わらせた方が良いだろう。これは今、エーテル官能基とエステル官能基を1つずつ導入して、1つのエステル官能基を置き換えているのだ。完璧とは言えないが、アルコールと酸に分かれるよりはましだろう。小さい分子ではエーテル導入の誤差は大きいが、小さい分子ではY-MBでOKだ。このような分割が必要な大きな分子では、エーテルの誤差は重要ではないでしょう。あるいは、科学者として誤差が大きいと思うのであれば、別の方法で分割を行なえばよい。
塩、遷移金属錯体などのSMILESが入力できないのですが？
塩や遷移金属錯体、イオン液体などのSMILESを入力して、良いY-MB計算値を得ることができれば、ユーザーはとても喜ぶだろう。でも、これは不可能である。
イオン液体については電子書籍に章があるので，ここでは触れない。しかし、一般的なポイントは、塩や遷移金属錯体のHSP値について話すのは全く理にかなっているが、それを予測できない理由は、そのような分子のHSP値を含んだデータセットが何千と無いからだ。だから，Y-MBはそれらのデータで “訓練 “する事ができない。だから，例えばNa+官能基の値を見つける事ができないのだ。
だから，例えば有機エレクトロニクス（OPV，OLEDなど）の研究をしているのであれば，自分の分子についてY-MBの推算に頼れないのはもどかしいことだ。しかし，HSPにおける “真実 “は実験データから得られることを忘れてはならない。もし、システムを正しくセットアップすれば、多くのHSPの値を測定するのはとても簡単だ。特に、それらがたまたまHSP空間の1つの部分にある場合、溶媒やグリッドの選択によって、少ない実験で多くのデータを得ることができるのだ。もし、そのような測定を日常的に行っていないのであれば、少なくともヨーロッパでは、HSP値のハイスループット測定サービスを提供する会社が2社あり、世界の他の地域でもサービスプロバイダーが現れることを期待している。
不可能なSMILESについて話している間に、もうひとつ「点のついたSMILES」についての質問がある。単純な例として，酢酸アンモニウムはN.CC(=O)Oと表示されるかもしれない-アンモニアと酢酸のSMILESの間に重要な「点」があるのだ。原則的には個々のHSPの推定値を提供することもできるが，我々は点線のついた構造は多くの疑問を引き起こすので，許容しないことにした。例えば、分子が本当は酢酸アンモニウムなのに、アンモニアと酢酸のHSPを提供することに何の意味があるのだろうか？
HSPiPはなぜXができないか？
考えられる理由は3つあります。1つ目は、「できない」ということ。2つ目は、可能であり、それに取り組んでいるということ。 そして、それに興味を持つ誰かからの手助けを歓迎する。3つ目は、HSPiPに追加することは考えていなかったということだ。私達はHSPiPの機能を追加して欲しいという要望を受けるのが好きだ。だから、あなたの要望リストを送ってくれれば、HSPiPの実用性を高める機能を追加するために最善を尽くそう。HSPiPは過去数年の間に目覚しい発展を遂げたが、その理由の大部分は大規模なユーザーコミュニティーからの意見によるものだ。
なぜ、古典的なSphereフィットとGA（Genetic Algorithm）などの代替フィットとで、これほどまでに異なる回答が得られるのでしょうか？
それぞれのフィッティングアルゴリズムで、可能な限り広い範囲のフィッティングが探索される。もしデータが本当に良くて、溶媒の点がHSP空間の良い範囲をカバーしていれば、計算された値はごくわずかにしか変化しない、つまり、一つの明確な全体最適がある。しかし，データが良くない場合，特に，実球を囲む点が得られない場合は，数学的に等価なフィットが非常に多く存在することになる。大きなばらつきがあるということは、残念ながら、あなたのデータは曖昧さのないフィットを与えるには十分でないという証拠だ。もし、別の方法（例えば、クラシックとGAを入れ替えるなど）を使えば、違う答えが得られるかもしれません。
どうすればいいのだろうか？通常、一番手っ取り早いのは、Sphereプロットを見て、δD, δP, δHの中で該当する溶媒がない部分を見つけることだ。あとは、余分な溶媒を使って実験をして、その結果をHSPiPに追加するだけだ。もちろん、他のデータポイントを繰り返す必要はありませんから、余分な作業は本当にわずかだ。我々はこの方法を何度も使ったが、慎重に選んだいくつかの溶媒を追加するだけで、フィットの質は大きく改善された。注意深く選択する “ということを強調しなければならない。例えば、メタノールが妥当なフィットから大きく外れている場合、エタノール、プロパノール、ブタノール…のデータポイントを追加しても、余分な作業で実益がない。
良いデータセットでは、古典的な手法とGAによる適合の値は同じになります。しかし、外れ値がある場合、2つの方法は外れ値に対処するために異なるスコアリングシステムを（意図的に）使用するため、適合度は異なる。ある時は古典的な適合を好み、ある時はGAを好む。HSPiPのポイントは、ユーザーが十分な情報を得た上で判断できるようにすることだ。だから、外れ値を調べて、どちらの適合がより化学的に理にかなっているかを見てほしい。
ポリマーやその他の溶質の球の半径を推算するにはどうしたらよいですか？
簡単に言えば、「できない」ということだ。これはHSPのユーザーにとってしばしば残念なことだが、不可能な理由はたくさんある。
半径が意味を持つのは、特定の用途においてのみだ。だから、同じポリマーを使っている二人のユーザーが、まったく異なる半径を持つかもしれない。なぜか？ 例えば、あるユーザーが長期間の使用によるポリマーの膨潤を心配しているとしよう。多くの溶媒はポリマーを溶かすことなく膨潤させる。だから、半径は大きくなる。別のユーザーは濃厚なポリマー溶液を作ることだけに興味があるとする。多くの溶媒は良い溶媒ではないので，半径はかなり小さくなる。
同じポリマーを使う2人のユーザーが同じ一般的な用途（例えば溶液の作成）だとしても，一方は低分子量グレードを使い，もう一方は高分子量グレードを使うかもしれない。前者の半径は後者より大きくなる。
同じポリマーであっても、分子量が同じでも、分岐の度合い、（偶然の）架橋、「ブロック性」などが異なる可能性がある。
半径予測の科学的根拠はよく知られているが、それは理想的な状況における理想的なポリマーにのみ適用されるものであり、私たちが好んで使用する現実のポリマーには当てはまらない。
これらの問題はHSPの制限事項ではなく、強みだ。Sphereメソッドは2つの情報を与えるように設計されており、それを使って処方することができる。一つ目はSphereの中心だ。これは一般に全てのユーザーにとって同じであろう。もう1つは半径で、これはあなたのポリマーとあなたの基準に特有のものだ。HSPiPは同じポリマーに複数の半径を作ることを推奨している。0, 1だけでなく、1, 2, 3, 4…とスコアリングする事で、1つのデータセットから異なる球を計算する事ができるようになる。即座に簡単に溶ける溶媒はスコア1，ゆっくり溶ける溶媒はスコア2，ただ膨潤する溶媒はスコア3，というように。もし，3を “良い “溶媒として含めると，大きな半径が得られ，膨潤の用途に適用できる。
しかし、それは主観的なものばかりではない。ポリマーを溶媒に溶かすという基礎科学はよく知られており、HSPiPにはその科学を探求するためのモデラーがある。この科学は単分散の純粋なポリマーに対しては、注意深い実験条件下でうまく機能するので、半径やその変動は少なくとも後から考えても説明可能である。しかし、このような純粋なポリマーの結果と、実際の用途に使われる市販のポリマーの現実には大きな隔たりがある。そこで半径を測定するSphere法は、ほとんどの場合、私たちが使っている実験的を用いた方法なのだ。
HSPiPを購入すると、電子商取引サイト「MyCommerce」から領収書が発行されるのですか？
それが、MyCommerceを利用する理由の一つだ。eコマースサイトは、お客様の地域に関連する複雑な税金をすべて処理するので、最終的な請求書と領収書はお客様に正しく表示されることになります。
なぜ、オフラインでの購入に追加料金がかかるのですか？
企業のクレジットカードを使ったオンライン購入は、誰にとっても迅速で簡単だが、見積書、請求書、国際送金などのオフライン購入は、誰にとっても大変な作業だ。そのため、100ドルの管理費を徴収することで、企業や研究機関がこのような旧態依然とした方法で我々の製品を購入することを控えるようになればと願っている。
インストール時や初回起動時に、予期せぬマイクロソフトのコードが表示されるのはなぜですか？
これは、企業ネットワークでのパーミッションに関係するようで、よくわからない問題だ。解決策としては、MyDocuments/HSPiPのDataフォルダーをMyDocuments/HSPiP OldDataのようにリネームして、インストールし、OldDataフォルダーにある自分のファイルを新しいものにコピーしてから、最後に古いフォルダーを削除すればいいようである。初回起動時の問題は、通常、HSPiPが設定を保存するための単純な.txtファイルの書き込みや、.hsdファイルのロード/セーブさえできないような、非常に厳しい「パーミッション」コントロールが原因だ。IT部門は、ユーザーのマイドキュメント（My Documents）フォルダーのパーミッションを少し緩める必要がある。
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