塩野義のゾコーバ緊急承認。他の薬とのハンセン溶解度パラメータの関係

コロナ用経口薬のハンセン溶解度パラメータ(HSP)は分子を３つに分けて解釈すると良いという事を書いてきた。分子を分割して部分ごとのHSPを求めるやり方は、アバター・チュートリアルで説明したからもうお分かりだろう。塩野義のエンシトレルビル（商品名：ゾコーバ）も同じように計算してみた。

それでは、塩野義のエンシトレルビルのHSPとメルクのモルヌピラビルやファイザーのパキロビッドパック(ニルマトレルビル/リトナビルの混合薬）のHSPとどんな関係にあるのだろうか？

分子を分割して、部分ごとのSmilesの構造式を作成する。
HSPiPのY-MBを使って各SMILESのHSPを計算すれば、1分でこんなテーブルを手に入れることができる。

No.	Solvent	δD	δP	δH	Color	MVol	SMILES
1	モルヌピラビル	18	9.1	14.3	1	246.7	CC(C)C(=O)OCC2OC(n1ccc(=NO)[nH]c1=O)C(O)C2O
2	Mo-L	15.6	5.1	6.1	1	115.9	COC(=O)C(C)C
3	Mo-C	16.4	7.6	13.5	1	140	CC1OC(C)C(O)C1O
4	Mo-R	20	10.1	16.1	1	102.4	Cn1ccc(=NO)[nH]c1=O
5	ニルマトレルビル	18	19.1	5.8	2	379.7	CC(C)(C)C(NC(=O)C(F)(F)F)C(=O)N1CC3C(C1C(=O)NC(C#N)CC2CCNC2=O)C3(C)C
6	PF-L	15.5	9.1	5.6	2	163.8	CC(C)(C)CNC(=O)C(F)(F)F
7	PF-C	18.4	13.1	7.5	2	183	CNC(=O)C1C2C(CN1C(C)=O)C2(C)C
8	PF-R	18	12.6	7.2	2	139	CC(C#N)CC1CCNC1=O
9	リトナビル	20	10	4.5	4	580.9	CC(C)c4nc(CN(C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](Cc1ccccc1)C[C@H](O)[C@H](Cc2ccccc2)NC(=O)OCc3cncs3)cs4
10	Ri-L	19.2	8.7	9.9	4	240.7	C[C@H](O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)OCc2cncs2
11	Ri-C	18.2	10.2	7.4	4	286.8	CC(C)[C@H](NC(=O)N(C)C)C(=O)N[C@H](C)Cc1ccccc1
12	Ri-R	17.4	4.6	4.8	4	142.9	Cc1csc(C(C)C)n1
13	Ensitrelvir（塩野義）	20.7	10.6	3.4	6	351.8	Cn1cnc(CN2C(=O)N(Cc3cc(F)c(F)cc3F)C(=N\c3cc4cn(C)nc4cc3Cl)\NC2=O)n1
14	En-L	17	4.5	3.7	6	118.4	Cc1cc(F)c(F)cc1F
15	En-C	18.4	13	5.9	6	188	CN=c2[nH]c(=O)n(Cc1ncn(C)n1)c(=O)n2C
16	En-R	19.4	5.8	4.2	6	146.8	Cc2cc1cn(C)nc1cc2Cl

薬をMaterials Informatics(MI)で扱いたいだけならこれで良いだろう。後はAIが考えてくれる。
しかし、人間が理解しようとすると、ちょっと厳しいかもしれない。
そこで、このデータをハンセン空間にプロットしてみる。ハンセン空間というのは、δD,δP,δHをX,Y,Z軸にプロットしたものだ。（δDのX軸だけ倍に広げてある。）

大きな球が４つ、小さな球が12個表示されているだろう。
赤い球はモルヌラビル
マゼンタの球はニルマトレルビル
水色の球はリトナビル
青い球は塩野義のエンシトレルビルを表している。

大きな球は分子全体のHSP,対応する色の小さな球は分子の左側(L)、真ん中(C)、右側(R)の構造部分のHSPを示している。

画面の中でマウスをクリックしたまま動かし（ドラッグし）て見やすい位置を探してみよう。球の中心あたりをクリックすると画面左上に部分の名称が現れる。
（Shiftキーを押したままドラッグすれば拡大・縮小する）

モルヌラビルは少し離れた位置にいる。
ファイザーのニルマトレルビル/リトナビル混合薬（パキロビッド）と塩野義のエンシトレルビルの位置関係を良く見てみよう。

塩野義のエンシトレルビル（青色）の大きな球はリトナビル（水色）の大きな球と同じような位置にいる。つまり両者の全体としてののHSPはほぼ同じになる。
また、塩野義のLとリトナビル-Rはほぼ同じHSPになっている。

塩野義のCはニルマトレルビル（マゼンタ）のC,Rとほぼ同じ位置にいる。

これらの事を考えると、ぜひ試して欲しいのは、
ファイザーのニルマトレルビルと塩野義のエンシトレルビルの混合薬だ。

塩野義のRが何か役に立っているのか？わかったら面白い。

HSPiPでこのようなプロットを行う方法を模索している。
投票が増えたらアバター・チュートリアル化することも考えるかな。

今のプロットはSphereViewerというJavaScriptの自作ソフトだ。
pirikaの研究会のメンバーには使いかたを教えていたりする。そちらの方が先にチュートリアルになるかもしれない。

読んだ人のリアクション次第だ。
もちろん薬屋さんがネギ背負って来てくれればもっと良い。

HSPiPの開発を一緒にやっているAbbott教授が、日本語のブログを読んで、すぐにプログラムを修正してくれた。

ちょっとやり方を学んでみよう。

「薬屋さんがネギ背負って来てくれれば」の意味がわからず色々調べたようだ。
（Googleではカモネギが出てきて、相手を騙すこととあるようだ）

これが近いのかと聞いてきた。
“To cry with one eye like a donkey”（ロバのように片目で泣く）
“To cry crocodile tears”（ワニの涙を流すこと）

その意味は
“to pretend to be sad about something”（何かを悲しんでいるふりをすること）

ちょっと違う気がする。
ネギ（研究費）持って来てくれたら、美味しい鍋（研究成果）を食べるのに参加させてあげるって事で、騙そうって言う意味はない。ただし、鍋を囲めるのは一業種一社の早い者勝ちだけど。